Norsk Nukleær Dekommisjonering har sitt hovedfokus på dekommisjonering av atomforskningsanlegg i Norge, med spesielt ansvar for driften av atomanlegget i Halden. Organisasjonen jobber med tre hovedoppgaver: drift, dekommisjonering og lagring av radioaktivt avfall. Dette inkluderer også bygging av lager og deponi for radioaktivt avfall, samt håndtering av slikt avfall fra industrien.
I tillegg til de nasjonale oppgavene, deltar Norsk Nukleær Dekommisjonering i internasjonalt samarbeid om avfallshåndtering. Organisasjonen legger vekt på bærekraft og miljø, og arbeider for å sikre åpenhet og involvering av sivilsamfunnet i prosessene som omhandler dekommisjonering og avfallshåndtering. Det utarbeides også konseptvalgutredninger for deponering av radioaktivt avfall, noe som er en viktig del av deres langsiktige planer.