NIKU Trondheim er en del av Norsk institutt for kulturminneforskning, som fokuserer på forskning og utvikling innen kulturminneforvaltning. Instituttet arbeider med prosjekter som omhandler bevaring, dokumentasjon og formidling av kulturhistoriske ressurser. NIKU Trondheim bidrar til å utvikle metoder og verktøy for å bedre forstå og forvalte kulturminner i ulike kontekster.
Forskningen ved NIKU Trondheim omfatter tverrfaglige tilnærminger, der både naturvitenskapelige og humanistiske metoder benyttes. Instituttet samarbeider med universiteter, forskningsmiljøer og kulturminneforvaltende myndigheter for å fremme kunnskap og kompetanse innen feltet. NIKU Trondheim deltar også i internasjonale prosjekter og nettverk, noe som bidrar til å styrke den nasjonale og internasjonale forskningskapasiteten innen kulturminneforskning.