Stiftelsen Wøyen har som formål å styrke barnevernet gjennom utdeling av midler til ulike tiltak. Stiftelsen prioriterer forsknings- og utviklingsvirksomhet innen barnevern, og legger vekt på kunnskapsformidling og rådgiving til barnevernspersonell. Dette inkluderer behandling av søknader om prosjektmidler som er rettet mot barnevernstiltak.
Historisk sett har stiftelsen sin bakgrunn fra barnehjem, og har utviklet seg til å finansiere prosjekter som involverer barn og unges medvirkning. I tillegg samarbeider den med utdanningsinstitusjoner for å fremme forskning innen barnevern, noe som bidrar til en bedre forståelse og utvikling av tiltak som gagner barn og unge i sårbare situasjoner.